急性肾盂肾炎需与急性膀胱炎区别前者除有膀胱刺激症状外，还有寒战、高热和肾区叩痛结核性膀胱炎发展缓慢，呈慢性膀胱炎症状，对药物治疗的反应不佳尿液中可找到抗酸杆菌，尿路造影显示患侧肾有结核病变。膀胱炎与间质性膀胱炎的区别后者尿液清晰，极少脓细胞，无细菌膀胱充盈时有剧痛，耻骨上膀胱区可触及饱满而有压痛的膀胱。嗜酸性膀胱炎的临床表现与一般膀胱炎相似区别在于前者尿中有嗜酸粒细胞，并大量浸润膀胱粘膜。膀胱炎与腺性膀胱炎的鉴别诊断主要依靠膀胱镜检查和活体组织检查。
慢性膀胱炎症状长期存在且逐渐加重一般培养无细菌生长，又找不到原发病时，要考虑肾结核肾结核病人半数以上有肺与生殖器等肾外结核病史，血尿多与尿路刺激症状同时出现，抗痨治疗有效膀胱炎时，血尿为“终末血尿”，且抗菌治疗有效结核杆菌培养、尿沉渣找结核杆菌、肾盂造影及膀胱镜检查有助于诊断有时肾结核常与普通尿路感染并存。如患者经过积极抗菌治疗后，仍有尿路刺激症状或尿沉渣异常应高度注意肾结核存在的可能性，宜作相应检查。
慢性膀胱炎需与膀胱癌鉴别
